Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC1Q13547 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC1Q13547 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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