Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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