Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB2A2Q13296 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms