Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 APC2YLR127C 2562 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 PHO92YDR374C 921 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YGL242CYGL242C 546 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YMR144WYMR144W 1029 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 RTG3YBL103C 1461 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 CLB5YPR120C 1308 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YGR064WYGR064W 369 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 SPO12YHR152W 522 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 RNP1YLL046C 750 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YOR203WYOR203W 354 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 MLH3YPL164C 2148 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 LRS4YDR439W 1044 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 MSA2YKR077W 1092 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 UBX4YMR067C 1251 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 SPO77YLR341W 1434 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 SUI2YJR007W 915 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 RRT15YLR162W-A 189 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YRO2YBR054W 1035 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 DAL5YJR152W 1632 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 IFH1YLR223C 3258 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 snR76snR76 109 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 GLC7YER133W 939 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YMR31YFR049W 372 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 LDH1YBR204C 1128 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 RRP6YOR001W 2202 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 STB4YMR019W 2850 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 ZRG8YER033C 3231 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YDL062WYDL062W 426 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 GTR2YGR163W 1026 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 RPA12YJR063W 378 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YLR379WYLR379W 375 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 PIN3YPR154W 648 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 MFB1YDR219C 1398 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 PUF4YGL014W 2667 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 MED8YBR193C 672 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 NCL1YBL024W 2055 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 PRK1YIL095W 2433 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 BNA7YDR428C 786 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YJL169WYJL169W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 LTO1YNL260C 597 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 APC5YOR249C 2058 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 SWI6YLR182W 2412 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 TAH1YCR060W 336 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 CKA1YIL035C 1119 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BLQ12490 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 SNC1YAL030W 354 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 FCF2YLR051C 654 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 CTL1YMR180C 963 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 NUP145YGL092W 3954 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RPL31AYDL075W 342 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 ACB1YGR037C 264 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RSA3YLR221C 663 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 ATG5YPL149W 885 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 UBP11YKR098C 2154 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YNR066CYNR066C 1311 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 ESC2YDR363W 1371 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 HLR1YDR528W 1272 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 LTP1YPR073C 486 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 CRD1YDL142C 852 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RGI2YIL057C 495 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 VTI1YMR197C 654 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 BAG7YOR134W 1230 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RPL37BYDR500C 267 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 PFK27YOL136C 1194 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YPL238CYPL238C 390 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 BIT61YJL058C 1632 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RMD5YDR255C 1266 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 MUM3YOR298W 1440 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 MRP49YKL167C 414 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YLR290CYLR290C 834 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 DYN3YMR299C 939 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 PEX27YOR193W 1131 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 FUS1YCL027W 1539 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 NYV1YLR093C 762 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 YMR181CYMR181C 465 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 PRM4YPL156C 855 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BLQ12490 PBP4YDL053C 558 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 TAN1YGL232W 870 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 VOA1YGR106C 798 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SRN2YLR119W 642 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YLR444CYLR444C 303 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SHR3YDL212W 633 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 BTT1YDR252W 450 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 COBQ0105 1158 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 PRM6YML047C 1059 nt0.77□□□□□ -2.29
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