Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF1Q10570 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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