Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCBP1Q09161 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCBP1Q09161 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms