Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms