Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms