Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD47Q08722 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD47Q08722 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms