Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 CSR2YPR030W 3366 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YGR025WYGR025W 303 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YAR070CYAR070C 300 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YML037CYML037C 1023 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YNL058CYNL058C 951 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YPR039WYPR039W 336 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 ECM25YJL201W 1800 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 RGR1YLR071C 3249 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 BUB1YGR188C 3066 nt3.48□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 POL2YNL262W 6669 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 DYN1YKR054C 12279 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 BAS1YKR099W 2436 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 ATG31YDR022C 591 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 CAJ1YER048C 1176 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YLR287CYLR287C 1068 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 BSC3YLR465C 309 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 AIM32YML050W 936 nt3.47□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 PUF4YGL014W 2667 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 GIS4YML006C 2325 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 PUF6YDR496C 1971 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 SDH7YDR511W 402 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 JIP3YLR331C 378 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 RPS7BYNL096C 573 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YPL185WYPL185W 396 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YSW1YBR148W 1830 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 GCD6YDR211W 2139 nt3.46□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 NET1YJL076W 3570 nt3.45□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.45□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 TIM8YJR135W-A 264 nt3.45□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 LCL2YLR104W 396 nt3.45□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 GPX2YBR244W 489 nt3.45□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YHR078WYHR078W 1659 nt3.44□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 GPI8YDR331W 1236 nt3.44□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 HIT1YJR055W 495 nt3.44□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YKR033CYKR033C 426 nt3.44□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 PES4YFR023W 1836 nt3.44□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 ITC1YGL133W 3795 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 SSE1YPL106C 2082 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 snR76snR76 109 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 HYR1YIR037W 492 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 GYP7YDL234C 2241 nt3.43□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 BRO1YPL084W 2535 nt3.42□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 snR70snR70 164 nt3.42□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YOR105WYOR105W 327 nt3.42□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.41□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 RPS24BYIL069C 408 nt3.41□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 ICY1YMR195W 384 nt3.41□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 MGR1YCL044C 1254 nt3.41□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 PSO2YMR137C 1986 nt3.41□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 BPT1YLL015W 4680 nt3.4□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 RAX2YLR084C 3663 nt3.4□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 NAB6YML117W 3405 nt3.4□□□□□ -1.86
NSE3Q05541 YDL068WYDL068W 330 nt3.4□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 DIE2YGR227W 1578 nt3.4□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 PET191YJR034W 327 nt3.4□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 GCD10YNL062C 1437 nt3.4□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 GNT1YOR320C 1476 nt3.4□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YJL016WYJL016W 1686 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 MET6YER091C 2304 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YPL150WYPL150W 2706 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 RPL20AYMR242C 519 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 MKT1YNL085W 2493 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 TPS2YDR074W 2691 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YPK1YKL126W 2043 nt3.39□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 DNL4YOR005C 2835 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 MRPL50YNR022C 420 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YPR197CYPR197C 564 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 SPC72YAL047C 1869 nt3.38□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 SNX41YDR425W 1878 nt3.37□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 USE1YGL098W 738 nt3.37□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YLR458WYLR458W 381 nt3.37□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 TRM7YBR061C 933 nt3.37□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YBR197CYBR197C 654 nt3.37□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 RAM2YKL019W 951 nt3.36□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YLR434CYLR434C 384 nt3.36□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 RGM1YMR182C 636 nt3.36□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 DUG2YBR281C 2637 nt3.36□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 SNQ2YDR011W 4506 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 DBP7YKR024C 2229 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 SEC22YLR268W 645 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 NAB3YPL190C 2409 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 NUP82YJL061W 2142 nt3.35□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 FRE2YKL220C 2136 nt3.34□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.34□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.34□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 UBC7YMR022W 498 nt3.34□□□□□ -1.87
NSE3Q05541 SKT5YBL061C 2091 nt3.34□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RSN1YMR266W 2862 nt3.33□□□□□ -1.88
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