Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC7A5Q01650 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC7A5Q01650 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms