Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms