Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIM1P81133 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms