Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL8P80075 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL8P80075 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL8P80075 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms