Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSCP56915 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSCP56915 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSCP56915 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSCP56915 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSCP56915 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GSCP56915 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms