Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFDNP55196 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFDNP55196 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFDNP55196 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms