Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCL1P53675 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms