Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDST1P52848 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDST1P52848 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDST1P52848 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDST1P52848 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDST1P52848 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDST1P52848 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms