Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATMP50440 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATMP50440 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATMP50440 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATMP50440 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATMP50440 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATMP50440 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms