Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFBP49765 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFBP49765 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms