Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK8P49336 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK8P49336 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms