Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms