Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCLMP48507 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms