Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCAMP43121 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCAMP43121 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCAMP43121 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms