Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PIK3CBP42338 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CBP42338 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms