Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms