Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB2P35606 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPB2P35606 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPB2P35606 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPB2P35606 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms