Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT9P35527 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT9P35527 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT9P35527 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT9P35527 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT9P35527 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT9P35527 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms