Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC8A1P32418 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC8A1P32418 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC8A1P32418 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC8A1P32418 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC8A1P32418 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC8A1P32418 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms