Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCKARP32238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCKARP32238 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKARP32238 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKARP32238 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKARP32238 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKARP32238 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms