Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SSFA2P28290 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSFA2P28290 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms