Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODC1P11926 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODC1P11926 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ODC1P11926 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODC1P11926 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms