Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms