Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HKR1P10072 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HKR1P10072 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HKR1P10072 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HKR1P10072 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms