Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP3A4P08684 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP3A4P08684 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms