Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFMP07197 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFMP07197 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFMP07197 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFMP07197 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFMP07197 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFMP07197 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms