Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDHBP07195 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDHBP07195 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDHBP07195 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHBP07195 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHBP07195 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHBP07195 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms