Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX7O95931 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX7O95931 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX7O95931 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX7O95931 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms