Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL1O95922 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms