Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX58O95786 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX58O95786 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX58O95786 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX58O95786 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms