Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB6O95452 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB6O95452 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB6O95452 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB6O95452 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB6O95452 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB6O95452 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms