Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBF1O95248 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBF1O95248 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBF1O95248 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBF1O95248 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBF1O95248 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBF1O95248 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBF1O95248 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBF1O95248 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms