Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms