Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLIT2O94813 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLIT2O94813 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms