Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA2O75334 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms