Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPLO60437 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPLO60437 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPLO60437 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPLO60437 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPLO60437 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPLO60437 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPLO60437 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPLO60437 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPLO60437 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms