Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms