Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1O43719 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms