Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP8B1O43520 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP8B1O43520 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms