Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRGAP3O43295 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms